Jernbanehistorie er museets årsskrift. Her bringes artikler inden for områderne teknologi-, kultur- og kunsthistorie. Jernbanehistorie udkom for første gang i december 2013.
Jernbanehistorie udkommer også digitalt (open office) med et års forsinkelse på Tidsskrift.dk
Jernbanehistorie giver plads til debat, diskussionsindlæg og faglig kritik af de artikler, som bringes i Jernbanehistorie.